À Coordenação de Ensino compete: 

I - planejar, coordenar e dirigir a implementação e a avaliação dos programas de ensino nas áreas Stricto Sensu, Lato Sensu e técnico, no âmbito do INCA; 
II - promover e avaliar eventos científicos de interesse do INCA; 
III - manter o Sistema Integrado de Bibliotecas e Informação do INCA; e 
IV - coordenar a produção de conteúdo educativo para os programas de ensino e eventos científicos de interesse do INCA. 

À Divisão de Ensino Stricto Sensu compete planejar, supervisionar e desenvolver programas de ensino stricto sensu no campo da oncologia e afecções correlatas. 

À Divisão de Ensino Lato Sensu e Técnico compete planejar, supervisionar e desenvolver programas de ensino lato sensu e técnico no campo da oncologia e afecções correlatas.

Ao Serviço de Educação e Informação Técnico-Científica compete planejar, gerenciar, supervisionar e executar as atividades relativas ao ensino à distância, informação e divulgação técnico-científica para: 

I - desenvolver os programas de educação à distância do INCA; 
II - coordenar o Sistema Integrado de Bibliotecas e coordenar as atividades da Biblioteca Central; 
III - garantir a observância à Política Editorial do Ministério da Saúde em todos os materiais educativos e técnico-científicos produzidos no âmbito do Instituto; 
IV - exercer a Secretaria Executiva do Comitê Editorial do INCA; 
V - apoiar a elaboração, editoração e produção de materiais de informação técnico-científica produzidas; e 
VI - divulgar os trabalhos técnico-científicos produzidos no âmbito do Instituto. 

Ao Serviço de Gestão Acadêmica compete supervisionar, controlar e executar as atividades administrativas relativas aos programas de ensino, seus usuários e estrutura física e tecnológica.